การเลี้ยงดูในตอนเล็ก ๆ ต้องระวังเรื่องของยุง และแมลงวันที่เข้ามากัดตาจนตาบอด บางครั้งอาจถึงตายได้ วิธีป้องกันควรใช้มุ้งปิดบ่ออนุบาลเพื่อกันยุงและแมลง
ซึ่งถือว่าได้ผลดีมาก น้ำในบ่อเลี้ยงก็ควรเปลี่ยนถ่ายเป็นประจำ สม่ำเสมอ เพื่อป้องกันโรคผิวหนัง และอีกปัญหาหนึ่งคือเรื่องของมิจฉาชีพที่จะเข้ามาขโมยจระเข้ก็เช่นกัน ถือเป็นเรื่องที่ต้องระมัดระวังทั้งหมด
