ไข่จระเข้มีลักษณะทรงรี มนเท่ากัน ไม่มีส่วนหัวส่วนท้าย เปลือกไข่สีขาวครีมหนาราว 1-1.5 มิลลิเมตร เปลือกไข่หนาและมีรูพรุนตามผิว ไข่จะประกอบไปด้วย
เปลือกไข่ เยื่อเปลือกไข่หุ้มไข่ขาวและไข่แดง เยื่อจะหนาและเหนียวเพื่อพยุงความเปราะของเปลือกไข่ไว้ ถึงแม้ไข่แตกไปเยื่อก็ยังอยู่ปกติ ทำให้ไข่สามารถที่จะฟักออกมาเป็นตัวได้
